《名侦探俱乐部拾光季》三生石下-飘花电影祭典举行的通知在镇内广播中回响，高中生柏木苍久违地与青梅竹马的琉青、一茶、桃花、碧、茜再度相聚。“今晚，直墨会被杀——”琉青的话让众人震惊不已。她亲眼目睹了同为青梅竹马的直墨之死，并在他宅邸的地下启动了时光机，回到了“现在”。更令人震撼的是，包括苍在内的六人都曾经历过时间跳跃。为了阻止“即将发生的青梅竹马之死”，苍等人不断进行时光跳跃，逐步接近事件的真相。